根據職責，市商務局設12個內設機構。

辦公室

綜合協調機關政務工作；負責文電、會務、機要、檔案等機關日常運轉工作；負責機關工作制度建設、有關重要文件起草、重要事項的督辦與交辦事宜；承擔安全保密、來信來訪、政務公開、政務網絡建設、后勤服務、資產管理、車輛調度、安全保衛、對外宣傳等工作。

行政許可科

（綜合法規科、市進出口公平貿易辦公室、市產業損害調查局）

統一歸口管理和辦理對外貿易經營者、酒類經營備案登記；外商投資企業審批；依法核準權限范圍內的外商投資項目合同、章程及法律特別規定的重大變更；審核限額以上、限制投資和配額、許可證管理的外商投資企業的設立及變更；負責市級定點屠宰場確認工作；審核市內企業在境外投資開辦企業（金融企業除外）、對外經濟合作企業經營資格；以及涉及對外貿易、外商投資、對外投資與合作、內貿流通等領域的審批、備案等事項；協調處理本部門行政審批（許可）項目運行中相關問題。

監測全市商務運行狀況，研究結構調整中的重大問題，提出相關政策建議；承擔局機關規范性文件審核、行政復議和行政訴訟工作；歸口管理全市經貿外事工作，會同有關部門擬訂相關經貿外事工作制度，聯系涉外經濟商務機構有關事宜；承辦與進出口公平貿易相關的有關工作；協調對我市出口商品的反傾銷、反補貼、保障措施的應訴及相關工作；承擔涉及我市產業損害案件的調查，建立產業損害預警機制；開展產業競爭力調查、產業安全應對與效果評估；指導協調產業安全應對工作。

人事教育科

負責機關和直屬單位機構編制、人事管理工作；負責全市商務系統的干部教育和職工培訓；做好機關科室考核與機關干部考核、任免、獎懲，承辦機關后備干部的培養、選拔工作；落實黨的統戰、僑務、民族和宗教等政策；承辦出國人員政審工作。

財務科

負責編報財務計劃和會計報告，開展財務分析；研究提出與商務工作相關的財稅、金融、價格等政策建議；承擔歸口的各項業務資金、專項基金等使用和管理工作，編報預決算；承擔機關國有資產管理工作；承擔出口退稅涉及的相關工作。

市場秩序辦公室

（市12312商務舉報投訴服務中心）

承擔牽頭協調整頓和規范市場經濟秩序的相關工作；推動商務領域信用建設，指導商業信用銷售，建立市場誠信公共服務平臺；組織打擊侵犯知識產權、商業欺詐、商業壟斷等工作；負責研究制定藥品流通行業發展規劃、行業標準和有關政策，配合實施國家基本藥物制度，提高行業組織化程度和現代化水平；建立藥品流通行業統計制度，推進行業信用體系建設，指導行業協會實行行業自律，開展行業培訓；承擔商務綜合行政執法和12312舉報投訴的處理與協調工作。

市政府商業網點建設辦公室

（市場體系建設辦公室）

負責組織實施全市農村市場體系建設、城鄉商業網點規劃；牽頭協調全市二手車流通、報廢汽車拆解、直銷等特種行業管理與有關聯席會議的具體工作；組織擬訂規范市場體系的政策；推進流通標準化；牽頭組織規范零售企業促銷行為；負責抓好全市大宗產品批發市場規劃和城鄉商業網點規劃、商業體系建設；推進全市農村市場和農產品流通體系建設；對拍賣、典當、租賃、汽車流通和舊貨流通行業等進行監督管理。

商貿服務管理科

承擔商貿服務業（含餐飲業、住宿業）的行業管理工作；推動流通體制改革和連鎖經營、商業特許經營、內貿電子商務和物流配送等現代流通方式的發展；組織實施國家和省安排的有關流通領域重大投資項目，推廣先進流通技術；指導社區商業發展、流通領域節能降耗工作；提出促進商貿中小企業發展的政策建議；按照有關規定對成品油流通市場進行監督管理；指導再生資源回收利用工作。

市場運行調節科

（市繭絲綢協調辦公室）

監測分析市場運行、商品供求狀況，調查分析商品價格信息，進行預測預警和信息引導；承擔建立健全生活必需品市場供應應急管理機制相關工作；承擔重要消費品儲備（肉類、食糖、小包裝食品等）管理和市場調控的有關工作；承擔酒類流通和繭絲綢協調工作。

對外貿易發展科

（市機電產品進出口辦公室）

指導各類對外經貿交易會、洽談會等貿易促進活動，推進外貿促進體系的建設，負責進出口孵化促進工作；擬訂外向產業發展規劃；負責重要工業品、原材料、農產品進出口計劃的組織實施；做好進出口配額的上報等相關工作；擬訂促進外貿基地建設的政策措施，推動出口產品國際認證和商標注冊，指導出口品牌建設；負責全市機電出口產品技術更新改造、研發等項目申報及高新技術產品、管理技術的出口和技術引進工作；擬訂并執行市機電產品進出口、成套設備出口政策措施、中長期發展規劃和年度指導性計劃；承擔機電產品貿易、高新技術產品貿易促進工作；指導全市外貿電子商務建設；擬訂技術貿易政策和促進服務出口規劃、政策并組織實施；承擔技術進出口管理、服務貿易促進和服務貿易統計工作。

外商投資管理科

研究外商投資情況，指導外商投資工作；擬訂和實施利用外資政策，參與擬訂外商投資的中長期發展規劃和我市外商投資產業指導目錄；監督檢查外商投資企業執行有關法律、法規及合同、章程的情況，協調解決有關問題；指導和管理外商投資促進、外商投資企業進出口工作；負責外商投資統計工作；會同有關方面擬訂并組織實施促進服務外包發展的規劃、政策，推動服務外包平臺建設；促進經濟技術開發區的招商引資和進出口貿易工作。

對外投資與經濟合作科

擬訂對外經濟合作的有關政策措施，依法管理和監督對外投資、對外承包工程、對外勞務合作、設計咨詢等對外經濟和合作業務；負責組織、指導外派勞務人員的綜合培訓及培訓基地建設，外派勞務輸出基地建設；開展對外經濟多雙邊交流與合作，指導重大對外經濟合作項目的實施；承擔外派勞務和境外就業人員的權益保護相關工作；管理我市接受多雙邊和有關國際民間機構的無償援助項目及相關的業務；承擔對外直接投資、對外承包工程和勞務合作統計工作；擬訂本市人員出境就業管理政策，境外就業介紹機構資格認定、審批和監督檢查等工作。