英國人和馬來蘇丹于1895年簽署的邦咯島協約，使到英國人的勢力進一步從馬六甲海峽殖民地延伸到內陸的馬來州屬。通過律政司（ResidentSystem〕的制度，英國人逐漸全面的控制了整個馬來半島及新加坡。

        在英國人殖民的時期，英國人為了大量開發錫礦及樹膠園，從中國及印度大量的引進勞工，使到馬來西亞的多元種族的社會特征開始形成。 1942年第二次世界大戰，日本軍入侵馬來亞，把英殖民政府擊潰并統治了馬來亞三年零八個月。日本投降后，英軍回歸馬來亞繼續其殖民。1948年，英殖民政府宣布全國進入緊急狀況以對付馬來亞共產黨。

        1940年代末期及1950年代所掀起的爭取獨立運動，終于使到英殖民政府讓馬來亞于1955年進行了第一次的全國選舉，由代表馬來人的巫統、代表華人的馬華公會及代表印度人的印度國大黨所組成的聯盟（現在稱為國陣〕，橫掃了52議席中的51席。

        在北婆羅洲方面，沙巴從1882年就被英北婆羅公司統治，直到日本軍隊在第二次世界大戰攻入占領為止。砂勞越則是英人查爾斯布洛克和汶萊蘇丹協議下所建立起來的白人拉惹布洛克的天下。從1840年直到1942年，它都由布洛克家族所控制。在世界大戰過后，沙巴及砂勞越正式成為英國殖民地。

        1963年，馬來亞聯同新加坡、沙巴及砂勞越組成了馬來西亞聯邦。但1965年，由于東姑阿都拉曼及李光耀的政治分裂，新加坡宣布退出馬來西亞。

        1969年的全國大選成績，顯示人民對聯盟的支持急劇下降，反對黨所獲得的席位劇增。雖然聯盟仍然控制聯邦政府，但失去了吉蘭丹州政權，并在多個州議會里面對強大的反對黨勢力。1969年5月13日，反對黨的勝利游行在不同種族的相互嘲諷及挑釁的過程中，演變成種族沖突及流血事件，造成百多人喪失生命，無數財產被摧毀。此歷史事件被成為513事件。
        
        1970年，馬來西亞的商務習俗宣布實施為期廿年的新經濟政策，其目的是要消除貧窮，重組社會，以拉近貧富的鴻溝。但這項政策所實行的固打制，也使到非馬來人社會非常不滿。

        1972年，第二任首相敦拉薩改變了外交政策，開始和共產國家接觸，并致力使東南亞成為和平、自由及中立的區域。1974年，敦拉薩訪問中國，兩國的邦交自此一直密切發展至今。

        七十年代，馬來西亞的商務習俗開始其工業化計劃。新經濟政策廿年的成果，已經使到馬來人的經濟地位大大提升。1991年，第四任首相馬哈迪醫生宣布推行為期三十年的2020宏愿計劃，致力使馬來西亞在2020年成為先進國。

        馬來西亞的商務習俗直到目前為止，馬來西亞仍然以每年超過8％的成長率發展，成為其中一個世界上成長得最快的國家。目前馬來西亞共有十三個州，兩個聯邦直轄區。其首都為吉隆坡，是其中一個聯邦直轄區。