一、合同備案基本程序：
經貿部門審批
-->向海關服務中心購買空白《登記手冊》
-->合同預錄入
-->海關審核后開具《開設保證金臺帳聯系單》
-->向中國銀行申請設立臺帳--->海關核注銀行簽發的《臺帳登記通知單》
-->海關進行計算機異地傳輸--->收到傳輸成功回執后核發《登記手冊》。
二、合同備案所需單證：
1、經營單位申請報告。
2、外經貿主管部門《批準證》，屬于進料加工的需要加蓋稅務部門印章。
3、對外簽訂的進出口合同。
4、經營單位基本帳戶開立證明。
5、加工企業所在地經貿部門出具的《加工生產能力證明》。
6、委托加工應提供經營單位與加工企業簽定的符合《中華人民共和國合同法》的委托加工合同（協議）。
7、開展異地加工貿易，須提供經營單位所在地海關出具的關封，內含《異地加工申請表》一式二份。
8、首次開展加工貿易須提供經營單位和加工企業的《營業執照》、《稅務登記證》復印件及《海關登記通知書》。
9、經營單位的介紹信或委托書。
10、加工工藝說明。
11、如需異地口岸進出口報關，須填寫《異地報關申請表》。
12、海關需要的其他資料。
注：1）海關對首次開展加工貿易的企業實行驗廠制度；對單證齊全、驗廠合格的企業，海關在3個工作日內核發《登記手冊》。
2）辦理加工貿易合同備案的企業屬AA類的，免設臺帳；屬A類企業的，需設臺帳，實行“空轉”；屬B類企業的，需設臺帳，一般商品實行“空轉”，限制類商品實行“實轉”；屬C類企業的，需設臺帳，一律實行“實轉”；D類企業不得開展加工貿易業務。經營單位與加工企業非同一分類的，海關按就低不就高的原則管理。對外商提供的進口輔料品種在規定范圍內，且金額在5000美金以下的，免辦手冊，不納入臺帳管理。
三、辦理5000美元以下78種客供輔料備案手續所需單證：
1、申請報告。
2、進口發票、裝箱單（一式二份）。
3、出口合同（一式二份）。
4、經營單位介紹信或委托書。
四、合同核銷
（一）基本流程：
合同執行完畢后一個月內企業向海關申請核銷
-->預錄入
-->海關審核
-->簽發《臺帳核銷聯系單》
-->中國銀行銷帳
-->海關核銷結案
-->打印結案通知書。
注：企業必須在海關規定的期限內向海關辦理核銷手續。對無正當理由未向海關辦理核銷手續的，海關根據有關規定進行處罰。


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